真核生物和原核生物比較

	原核(Porkaryotes)	真核(Eukaryotes)
DNA合成酶(DNA Polymerase)	有三種： Pol I: 3' exonuclease: repair 5' exonuclease: 切RNA primer polymerase Pol II: Repair Pol III α: ε:3'→5' exonuclease β: form a ring around DNA θ:unknow	只有一種DNA polymerase 組成單元(Subunit) α:lagging strand replication β:repair γ:mitochorial DNA replication δ:leading strand replicaton ε:replication
RNA合成酶(RNA polymerase	只有一種 組成單元(Subunit) α:chain initiation, interaction with regulatory protein and upstram promoter elements β:chain initiation and elongation(holoenzyme) β':DNA binding σ:promoter recognition	有三種 Pol I:合成pre-rRNA 在核仁 Pol II:合成pre-mRNA 在核質 Pol III:合成pre-tRNA 和其僚small RNAs 在核質，5s rRNA
轉錄(Transcription)
起始(Initiation)	σ辨識啟動子(Promoter)→Closed-promoter complex→open promoter complex→mRNA合成(第一個是嘌呤pruine)→做10個後丟掉→σ離開→正式做mRNA Promoter:-35區域 至 -10區域	Pol I promoter: upstream promoter, core promoter 兩個輔因子: UBF1: 結合在兩個promoter上，特別是core promoter 的G-C rich SL1: UFB1結合上promoter後，SL1跟著上去
		Pol II promoter: TATA box(-25) Transcription factor:TBP and TFIID(enhancer, response element)
		Pol III promoter: downstream of star point(+55)-box A and boxC Transcription factor: TFIIIB and TFIIIC
終止(Termination)	Factor independent: GC rich→stem loop→mRNA上出現U-rich→release Factor dependent:ρ factor attenuation	Pol II 在mRNA上做出AAUAA之後，繼續往下移動，但在之後的11到30個base位置被endonuclease切掉，由poly(A) polymerase加上polyA
轉譯(Translation)
起始	SD sequence, start condon|)→50S→release IF1, 2, 3 第一個胺基酸: N-formylmethionine SD sequence:AGGAGG，位於<10 base upstream	Small subunit 和cap結合後，開始往3'移動，找到AUG後，large unit與small unit結合，開始轉錄eIF1, eIF1A, eIF2, eIF2B, eIF3, eIF4C, eIF4A, eIF4B, eIF4F, eIF5, eIF6 第一個胺基酸:methionine
延長因子(elongation factors)	EF-Tu 傳送aa-tRNA給ribosome EF-TS 使Tu再帶有GTP EF-G translocation factor	eEF1α eEF1β γ eEF2
終止(Termination)	UAA, UAG, UGA	UAA, UAG, UGA