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將此未知的蛋白質溶均勻解。利用 Beckman Optima XL_A Analytical ultracentrifuge離心。以OD280測此蛋白質離心時在溶液中位置的變化。當此蛋白質在溶液中位置穩定時,儀器會顯示明顯的peak,此時將各數據代入下列公式,計算出S值。離心時,另一離心管可置入已知蛋白質,其結果可與未知蛋白質作為參照。幾種已知的蛋白質如下表。

S = {v \over w^2r} = {m(1 - v-bar\rho) \over f} = {M(1-v-bar\rho)\over Nf}

S: sedimentation coefficient
v: velocity of the sedimenting particle.
v-bar: partial specific volume.
w: angular velocity of rotation in rad/sec
r: distance of the migrating particles from the central axis of rotation
m: effective mass of the sedimenting particle
ρ: density of the solution
M: molecular weight
N: Avogadro’s number 6.02×1023
f: frictional coefficient

幾種蛋白質的分子量與沈降係數编辑

蛋白質
分子量
沉降係數(S)
細胞色素C
13 370
1.17
肌紅蛋白
16 900
2.04
糜蛋白酶原
23 240
2.54
β-乳球蛋白
37 100
2.90
血红蛋白
64 500
4.50
血清白蛋白
68 500
4.60
過氧化氫酶
247 400
11.30
刀豆
482 700
18.60
纖維蛋白原
339 700
7.60

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